« La biodiversité : l'autre choc »

2007-06-05T14:33:35Z

Dans le cadre de l'étude de l'Office parlementaire d'évaluation des choix scientifiques et technologiques sur les apports de la science et de la technologie au développement durable, les sénateurs Pierre Laffitte et Claude Saunier ont invité plusieurs personnalités scientifiques pour répondre à leurs questions. Parmi ces personnalités, Jean weissenbach, le directeur du Genoscope, a participé à la table ronde : « Valoriser durablement la biodiversité. Comment la biodiversité peut-elle continuer à être la source des services indispensables et diversifiés que fournissent les écosystèmes, et devenir la future boîte à outils de la 4e révolution industrielle ? »

Voici un extrait de l'intervention de Jean Weissenbach lors de l'Audition publique du 28 mars 2007 :

-"[...] J'évoquerai principalement l'intérêt de la biodiversité des microbes dans un certain nombre d'applications, notamment dans le domaine de la chimie. Comme il a été souligné, nous ignorons encore le nombre d'espèces microbiennes existantes. Néanmoins, ce chiffre n'est pas aussi important que les fonctions biologiques que sont capables de remplir ces microbes. Là encore, nous ne disposons d'aucun inventaire, ce qui nécessitera un effort scientifique considérable. S'il y a quelques jours, Craig Venter a publié une liste de sept millions de gènes d'origine microbienne, nous ignorons les fonctions de la moitié d'entre eux, si ce n'est qu'ils servent vraisemblablement à procéder à des bioconversions. Or ces bioconversions sont essentielles pour préparer la chimie de demain. Dans la mesure où elle ne sera plus basée sur le pétrole, celle-ci nécessitera l'utilisation de catalyseurs et d'effectuer toute une série de réactions chimiques qu'actuellement, seule la nature est capable de faire. En effet, lorsque nous nous adressons à eux pour leur demander d'utiliser des enzymes, les chimistes nous répondent très souvent qu'ils n'y connaissent rien. J'ai notamment entendu ce type de réponse, il y a quelques semaines, lors d'une réunion de l'ANR, J'ai été particulièrement consterné de constater que nos collègues chimistes pensent encore en des termes très classiques. Il en est même de nos industriels, la seule façon de les convaincre étant de leur proposer des solutions « clé en main », c'est-à-dire de laisser le poids de l'effort de recherche sur les chercheurs. Or, actuellement, la situation de la recherche en France en matière de biochimie est plutôt préoccupante. La biochimie a été remplacée en effet par la biologie moléculaire, dont je suis l'un des représentants. Ainsi, les étudiants ne veulent-ils pas entendre parler de métabolisme ou de biochimie. Il est par conséquent essentiel que nous arrivions à inverser cette tendance, en nous inspirant notamment de nos pays voisins, comme l'Allemagne qui dispose toujours d'un niveau très satisfaisant en matière de biochimie. De même, son industrie chimique pense-t-elle beaucoup en termes de bioconversion. Il en est de même aux Etats-Unis. Nous devons donc fournir des efforts importants auprès des industriels et des pouvoirs politiques afin de relancer la recherche dans ces domaines."

Actes de l'audition du 28 mars 2007

« Succès de la première équipe française lors de la compétition iGEM de biologie synthétique »

2008-05-28T13:01:52Z

Dans le journal Médecine/Sciences du mois de mai 2008 nous est relaté le succès d'une équipe française, dont font partie quatre de nos Genoscopiens (Vincent Schächter, Gilles Vieira, François Le Fèvre et Serge Smidtas), dans la compétition étudiante internationale de biologie synthétique, iGEM, en novembre 2007 dernier, au MIT (USA).

« […] Le projet français : une bactérie « multicellulaire »
L'intérêt principal de l'organisme imaginé par les étudiants franciliens réside dans la possibilité de découpler l'expression d'un gène étranger ou transgène de la reproduction de l'organisme. Il ouvre ainsi la voie vers la production de composés toxiques pour la division cellulaire. L'expression de transgènes par des bactéries en bioréacteurs est devenue une méthode classique de production de certaines molécules (comme l'insuline). Cependant dans bien des cas, la synthèse du composé souhaité est toxique pour la bactérie. Cela limite, de fait, le rendement possible car on doit trouver un compromis entre la croissance de la bactérie et la production. En revanche, dans ce nouvel organisme bi-cellulaire, si seules les cellules « somatiques » expriment le transgène, alors on doit en principe pouvoir atteindre dans ces cellules des concentrations bien supérieures à ce qu'il est possible d'atteindre dans les systèmes d'expression classiques. Certes existe toujours un équilibre entre la croissance et la production du composé toxique. En effet ce composé ne doit ni empêcher les cellules somatiques de nourrir les cellules germinales, ni empoisonner ces dernières en diffusant trop aisément. Mais cet équilibre est déplacé vers une plus forte production en comparaison avec un système d'expression classique.
Une autre application consisterait à utiliser les cellules somatiques pour exprimer un transgène en dehors du laboratoire sans risque de fuite dans l'environnement. On peut en effet facilement induire la différenciation de toutes les cellules de la bactérie multicellulaire en cellules somatiques, incapables de proliférer. En revanche, elles continuent à grandir durant plusieurs heures en formant de longs filaments. Une application potentielle serait de faire stocker aux cellules somatiques des triglycérides dans des corps d'inclusion. Ces cellules pourraient être ingérées pendant le repas et absorberaient à notre place la graisse des aliments. Ce projet nommé « Diet Coli » (postiche du « Diet Cola ») est réalisable par expression de l'enzyme DGAT (diacylglycerol acyltransferase). L'équipe a montré que l'expression de la DGAT de Acinetobacter ADP1 [5] par E. coli induit en effet la synthèse de triglycérides, dans des proportions encore augmentées si des acides gras sont présents dans le milieu. […] »

Extrait de l'article :

« Succès de la première équipe française lors de la compétition iGEM de biologie synthétique »
David Bikard, François Képès, au nom de l'équipe iGEm Paris
Médecine/Sciences 2008 ; 24 :541-4

Création simulée par MGS d'une bactérie multicellulaire : les cellules rouges se divisent et se différencient en cellules vertes. Dans la nature, les bactéries sont toutes monocellulaires.

Pour en savoir plus :

MAIL des participants genoscopiens : nemoatgenoscope.cns.fr

SITES INTERNET
Poster et communiqué de presse->http://biosynthetique.free.fr/pdf]
Site du groupe « Réseaux métaboliques » à lequel appartiennent les 4 Genoscopiens
Site officiel de la compétition iGEM
Page de l'équipe francilienne sur le site officiel
Site de iGEM-in-Europe
Site du laboratoire virtuel de biologie synthétique français
Site du club de biologie systémique et synthétique du CRI
Site français de vulgarisation sur la biologie synthétique

LES AUTRES ARTICLES PUBLIÉS SUR CE SUJET :
« Un club scientifique pour créer de nouvelles formes de vie » de Annie Kahn, Le Monde, 13/01/2008.
"Un plan pour une révolution microbienne, des étudiants français récompensés par le MIT pour la conception d'un « organisme bactérien multicellulaire », de C.Bn, Libération, 29/01/2008 .
« BIOLOGIE SYNTHÉTIQUE, la France à l'honneur », de David Larousserie, Nouvel Observateur, 29/11/07.
"Un projet de biologie synthétique en trois mois d'été » de Dominique Chouchan, La Recherche, mai 2008.

Site du Genoscope

« La biodiversité : l'autre choc »

« Succès de la première équipe française lors de la compétition iGEM de biologie synthétique »